Synchytrium endobioticum картоп сүйел ауруын тудырады. Synchytrium endobioticum облигатты паразит, гифалар емес, спорангиялар тудырмайды, олардың құрамында қозғалғыш зооспоралары бар. Жазғы спорангиялар жұқа қабырғалы және қысқа өмір сүреді. Олар картоп тінінде түзіліп, жаңа зооспоралық инфекцияларды тудырады. Тыныштық споралары (кейде қысқы спорангиялар, қысқы споралар, тыныштық сори немесе қысқы сори деп те аталады) қалың қабырғалы және иесі болмаған кезде де өте ұзақ уақыт бойы өміршең болып қалады. Оларды бүкіл вегетациялық кезеңде өндіруге болады. Олар ыдырайтын сүйелдерден топыраққа шығарылады. S. endobioticum диагностикасы сүйелдер пайда болуы мүмкін өсімдікке де, топыраққа да қатысты.
тыныштықтағы спораларды тасымалдайды.
Көптеген патотиптер (нәсілдер) сипатталған S. endobioticum Бұлар картоптың дифференциалды сорттарындағы вируленттілігімен анықталады. 1-патотиптің (D1) қазіргі уақытта Еуропада картопты жұқтырғаны сирек кездеседі, себебі картоп сорттары оған сезімтал емес, бұл иесінің басым төзімділігіне байланысты. Басқа патотиптердің қазіргі уақытта Батыс Еуропада жиі кездесетіні және әсіресе Орталық және Шығыс Еуропаның жаңбырлы таулы аймақтарында кездесетіні туралы хабарланған. Олар Еуропадан тыс жерлерде де кездеседі (мысалы, Ньюфаундлендте, Канадада және Түркияның азиялық бөлігінде). Бұл патотиптерге төзімділік сирек кездеседі, сондықтан бақылау қиынырақ. 1-ден (D1) басқа патотиптер белгілі бір картоп сорттарына дифференциалды вируленттілігі арқылы ажыратылады, бірақ басқаша жағдайда 1-патотипке (D1) қарағанда бір-бірімен тығыз байланысты болып көрінеді. Ұсынылатын ішкі шаралар EPPO елдер патотиптерді анықтауды талап етеді.
Микроскопта байқалатын жазғы спорангиялардың немесе тыныштықтағы споралардың сәйкестігін кәдімгі ПТР арқылы растауға болады,
және нақты уақыттағы ПТР. Кәдімгі ПТР рибосомалық ДНҚ аймағының (ITS) ішкі транскрипцияланған аралық қосқышына негізделген, алдыңғы праймерді ITS1-ге және кері праймерді ITS2-ге күйдіреді. Ван Гент-Пелцер және т.б. нақты уақыттағы ПТР. (2010) ITS2 негізінде жасалған. Смит және т.б. нақты уақыттағы ПТР. (2014) мұнда сипатталған шағын суббірлік (SSU) рибосомасына негізделген
ДНҚ (18S рДНҚ). Bonants және т.б. әзірлеген нақты уақыттағы ПТР. (2015) полиморфты тізбектердің күрделілігін азайту (CRoPS) талдауы арқылы анықталған 1(D1)-ассоциацияланған бір нуклеотидті полиморфизм (SNP) патотипіне негізделген. Картоп сүйелінің материалын пайдаланған кезде, ДНҚ оқшаулауының тиімділігін бақылау үшін өсімдік COX геніне бағытталған ішкі оң оқшаулау бақылауы қолданылады. 1(D1) патотипін кем дегенде 2(G1), 6(O1) және 18(T1) патотиптерінен нақты уақыттағы ПТР арқылы ажыратуға болады.
Анықтама: PM 7/28 (2) Synchytrium endobioticum. EPPO Бюллетень, 47: 420–440. https://doi.org/10.1111/epp.12441




